馬祖地區解除戰地政務十餘年，各項建設均快速的發展，衛生醫療建設關係民眾的生命健康，更是重點項目。回想戰地政務終止之初，地區醫療資源貧乏，公共衛生相關建設及機制均未建置，民眾就醫極為不便，生命健康毫無保障。然而十年來，經過同仁們胼手胝足的努力，地區的衛生醫療環境已有了大幅度的提昇。我們建立了完善的24小時空中緊急救護機制，任何急重症病人，均可以在適當時間得到醫學中心最好的醫療照顧，不再因地處偏遠，交通不便而延誤病情。我們培育多位本土的專科醫師，引進台北市立醫院、台大、804等醫院各科專科醫師，重擴建縣立醫院、各鄉衛生所，充實各項醫療設備等，提供民眾現代化優質的醫療環境及品質，並推動保健、防疫、食品衛生、疾病篩檢等工作，以預防疾病促進健康。多年來的努力不但落實民眾的健康照顧，也使馬祖地區的民眾生命更有尊嚴 。

然而隨著地區快速的進步，生活水準的提昇，再加上科技醫療、生物科技的不斷的進步，本縣醫療環境的改善，必須更加努力，才能滿足民意的需求。由於人口的高齡化、社會快速的變遷、小三通的實施，再加上SARS風暴之後，引發更多新的公共衛生及醫療的問題，本局對於全縣公共衛生的發展，必須重新思考，重新出發 。

迎向未來，除了繼續維持優質的醫療環境，完善的緊急救護系統外，更要加速本土專科醫師的培育，充實現代化的醫療設備及環境，加強傳染病的防治、慢性病醫療、長期照護、社區精神醫療、國民營養、食品衛生等，落實疾病篩檢，並建立以家庭為中心的健康照護制度，使生活在地區的民眾均能有健康的身心，良好的生命品質，這是我們繼續努力的目標 。